La Autoridad Europea de Seguridad de los Alimentos (EFSA) ha emitido una opinión científica sobre el bienestar de ovejas y cabras durante el sacrificio. Ha identificado y caracterizado 40 peligros para el bienestar que podrían ocurrir durante el sacrificio, la mayoría de ellos relacionados con el aturdimiento y el sangrado. Ha identificado que el origen de 39 peligros es por el personal, al que se atribuyó falta de habilidades adecuadas para realizar las tareas y fatiga. 

La EFSA ha elaborado una serie de recomendaciones entre las que están:

• A la llegada, las ovejas y cabras deben descargarse sin demora y las que presenten signos de dolor intenso, signos de enfermedad o aquellas que no pueden moverse de forma independiente deben ser inspeccionadas y se debe aplicar sin demora un procedimiento para el sacrificio de emergencia.

• Se debe evitar tener ovejas y cabras en establos, a menos que beneficie su bienestar. Si no se puede evitar el corral, los animales deben tener acceso al agua y protección contra las condiciones climáticas adversas.

• Las hembras lactantes deben ser ordeñadas para liberar la presión de la ubre. Si es necesario ordeñar, el intervalo de ordeño no debe exceder las 12 h según lo prescrito en el Reglamento de la UE sobre transporte (Reg. CE 1/2005). 

• Debe evitarse la mezcla de cabras desconocidas, en particular de animales con cuernos. Los corderos lactantes y los cabritos son más susceptibles en comparación con los animales adultos a la sed y el hambre prolongadas. También son más propensos al estrés por frío y necesitan protección adicional en los establos. Por lo tanto, los corderos lactantes y los cabritos deben sacrificarse sin refugio. Si el sacrificio se retrasa, es necesario alimentarlos con un reemplazo de leche adecuado a intervalos regulares.

• Durante la manipulación, las ovejas y las cabras pueden experimentar dolor, miedo e impedimento de movimiento, que pueden evaluarse en función de resbalones, caídas, intentos de escape, vocalización, lesiones, desgana para moverse o movimientos hacia atrás. Las ovejas y cabras pueden manipularse y trasladarse utilizando animales conductores de la misma especie. No se deben utilizar perros. Cuando sea manipulado por operadores, se debe evitar un manejo doloroso, como levantar y arrastrar por los cuernos, la lana, una pata, golpear con un palo, etc. En su lugar, se deben utilizar estímulos pasivos como banderas y paletas.

• No se deben utilizar métodos de inmovilización, aturdimiento y sacrificio que causen mucho dolor y miedo. Para controlar la eficacia del método de aturdimiento, debe comprobarse el estado de conciencia de los animales inmediatamente después del aturdimiento, justo antes del corte del cuello y durante el sangrado. La muerte debe confirmarse antes de que comience el procesamiento de la canal.

• El aturdimiento eléctrico sólo en la cabeza da como resultado una pérdida de conciencia de corta duración y, por lo tanto, la responsabilidad de prevenir la recuperación de la conciencia, que conduce a un resultado de bienestar deficiente, depende de un sangrado rápido y preciso.  A la luz de la evidencia científica disponible en la actualidad, se requiere un mínimo de 1.0 A para garantizar un aturdimiento eléctrico efectivo de todas las ovejas y cabras, incluidos los corderos y cabritos.

• El aturdimiento con bala cautiva puede ser ineficaz a causa de una posición y dirección de disparo incorrectas y a parámetros de aturdimiento inapropiados. El uso de pistolas de bala cautiva no penetrantes para el aturdimiento de ovejas y cabras debe limitarse a animales de menos de 10 kg de peso vivo.

• La exposición al CO ₂ en concentraciones elevadas (superiores al 90% en volumen) es un problema de bienestar grave porque es aversivo y causa dolor, miedo y dificultad respiratoria. Falta evidencia científica sobre el impacto en el bienestar del uso de gases inertes y CO ₂ con gases inertes; por lo tanto, se recomienda más investigación.

• La hemorragia de animales aturdidos de manera ineficaz y de aquellos que recuperan la conciencia después del aturdimiento es un problema de bienestar grave, ya que provoca dolor, miedo y angustia intensos.

• No se debe practicar el sacrificio sin aturdimiento, ya que es un problema de bienestar grave porque provoca dolor intenso, miedo y angustia debido a la restricción del corte del cuello y el corte de los tejidos blandos del cuello que durarán hasta el inicio de la inconsciencia.

• Ciertas categorías de animales, como animales con cuernos pesados ​​o un vellón grueso o animales que provienen de sistemas de cría extensivos, deben manejarse con especial cuidado.